Oddělení transferu technologií (OTT) vzniklo přejmenováním Centra inovací a transferu technologií (CITT) založeného na ČZU v roce 2012. Oddělení se zabývá podporou spolupráce mezi univerzitou a privátním sektorem s cílem propojení výzkumného a technologického potenciálu univerzity s potřebami komerční sféry. Oddělení současně vykonává správu duševního vlastnictví univerzity a podporuje rozvoj podnikání mladých inovativních firem, které mají vysoký potenciál k růstu. OTT je ve své činnosti odpovědné prorektorovi pro rozvoj a udržitelnost.
OTT má své zástupce na všech fakultách a institutech ČZU, kteří jsou úzce napojeni na jednotlivé oborově zaměřené vědecké týmy či jednotlivce a fungují jako informační a distribuční kanály uvnitř univerzity. OTT má tak aktualizovaný přehled o probíhajících vědecko-výzkumných aktivitách napříč celou univerzitou.
